Satoshi ve Pikachu, daha fazla Pokémon yakalamak ve en iyisi olma yolculuklarına devam etmek için şanlı Kalos bölgesinin Lumiose Şehri'ne varmışlardır. Bu sırada, dahi mucit Citron ve küçük kız kardeşi Eureka, Satoshi ile karşılaşırlar ve Satoshi onları hemen bir dövüşe davet eder. Ancak, Satoshi'yi Kalos'a kadar takip eden Team Rocket'ın şehri birbirine katan bir Gaburias'a sebep olmasıyla, yakın

Satoshi ve Pikachu, daha fazla Pokémon yakalamak ve en iyisi olma yolculuklarına devam etmek için şanlı Kalos bölgesinin Lumiose Şehri'ne varmışlardır. Bu sırada, dahi mucit Citron ve küçük kız kardeşi Eureka, Satoshi ile karşılaşırlar ve Satoshi onları hemen bir dövüşe davet eder. Ancak, Satoshi'yi Kalos'a kadar takip eden Team Rocket'ın şehri birbirine katan bir Gaburias'a sebep olmasıyla, yakında tehlikeli bir olayın içine çekilirler. Uzaklardaki sessiz Vaniville Kasabası'nda, genç bir kız olan Serena, annesinin emriyle her günkü Sihorn binme antrenmanıyla boğuşmaktadır. Antrenmandan sonra, televizyonda Miare Şehri'nde meydana gelen olayları görür ve çocukluktan tanıdığı bir çocuğu fark eder. Hayatında önemli bir iz bırakan bu çocuğun görüntüsü, onu tekrar görüşme isteğiyle doldurur; ve böylece Serena, geçmişindeki çocuğu bulmaya kararlı bir şekilde Miare Şehri'ne doğru yola çıkar. Pokémon XY, grubun hedeflerinin peşinde Kalos boyunca seyahat edişini takip eder; Satoshi Pokémon spor salonlarını meydan okur, Citron Satoshi'den öğrenir ve Serena tam olarak hayalinin ne olduğunu arar. Yol boyunca yeni arkadaşlar edinir, yeni rakiplerle yüzleşir ve Team Rocket'ın planlarını engellemeye devam ederler, tüm bunlar olurken mega evrimin gizemleri hakkında küçük şeyler keşfederler.