Yeni Tokyo metrosu Touto Hattı'nın açılışının önemli günü gelmişti ancak bir bombalama olayı tüm kutlamaları durdurdu. Vali, trendeyken patlamada kaldı ancak kendisi ve orada bulunan herkes, Conan Edogawa'nın hızlı düşüncesi ve eylemleri sayesinde şans eseri kurtuldu. Olaydan etkilenen Conan, valinin siyasi geçmişini araştırır ve adamın Kitanosawa Barajı'nı inşa etmek için Niigata'da bir köyün yı

Yeni Tokyo metrosu Touto Hattı'nın açılışının önemli günü gelmişti ancak bir bombalama olayı tüm kutlamaları durdurdu. Vali, trendeyken patlamada kaldı ancak kendisi ve orada bulunan herkes, Conan Edogawa'nın hızlı düşüncesi ve eylemleri sayesinde şans eseri kurtuldu. Olaydan etkilenen Conan, valinin siyasi geçmişini araştırır ve adamın Kitanosawa Barajı'nı inşa etmek için Niigata'da bir köyün yıkılmasından sorumlu olduğunu öğrenir. Saldırının barajın inşasıyla ilgili olduğuna inanan Conan, Ran Mouri, Kogoro Mouri, Profesör Agasa, Sonoko Suzuki ve Dedektif Çocukları ile birlikte köye gitmeye ve araştırma yapmaya karar verir. Orada, yıkılmadan önceki eski köyde yaşayan bir grup yerliyle tanışırlar. Ancak bir gizem diğerini doğururken, yerlilerden biri öldürülür. İşlerin çok daha karanlık bir hal aldığından şüphelenen Conan, çok geç olmadan bu iki olayın ardındaki gerçeği ortaya çıkarmaya yemin eder.