Evrensel Yıl 0083. İsyan eden Zeon Prensipligî, Tek Yıl Savaşında Dünya Federasyonu tarafından yenilgiye uğramıştı. Ancak, Aguille Delaz liderliğindeki bir Zeon kalıntısı grubu, son savaştan kaçarak saklanmıştı. Üç uzun yılın ardından, Delaz'ın usta pilotu Anavel Gato'yu Federasyon'un bir araştırma üssüne sızarak gizlice geliştirilmiş iki prototip Gundam'dan birini ve ölümcül nükleer savaş başlığı

Evrensel Yıl 0083. İsyan eden Zeon Prensipligî, Tek Yıl Savaşında Dünya Federasyonu tarafından yenilgiye uğramıştı. Ancak, Aguille Delaz liderliğindeki bir Zeon kalıntısı grubu, son savaştan kaçarak saklanmıştı. Üç uzun yılın ardından, Delaz'ın usta pilotu Anavel Gato'yu Federasyon'un bir araştırma üssüne sızarak gizlice geliştirilmiş iki prototip Gundam'dan birini ve ölümcül nükleer savaş başlığını çalmakla görevlendirerek yeniden yükselmeye çalışırlar. Haydut Gundam'ın tehdidi altında ve barışı korumak isteyen Dünya Federasyonu, çalınan üniteyi geri almak için yeni geliştirilen Albion taşıyıcısını seferber eder. Kalan test pilotlarının komutasında, çaylak pilot Kou Uraki kalan prototip Gundam'ı kullanırken, Albion ve mürettebatı Gato'yu durdurmaya, çalınan Gundam'ı geri almaya ve Zeon kalıntılarının başka bir savaş başlatmasını engellemeye kararlıdır.