Saçılmış Jewel Seed olayını çözdükten sonra Nanoha Takamachi, sabahları sihir pratiği eklenmiş olsa da neşeyle günlük hayatına geri döner. Fate Testarossa ve Arthra'nın mürettebatıyla video mesajlaşan Nanoha, onlarla tekrar yüz yüze konuşma fırsatını sabırsızlıkla bekler. Ancak bir gün odasında ders çalışırken, Raising Heart aniden Nanoha'ya seslenir ve yaklaşan bir saldırı hakkında onu uyarır! S

Saçılmış Jewel Seed olayını çözdükten sonra Nanoha Takamachi, sabahları sihir pratiği eklenmiş olsa da neşeyle günlük hayatına geri döner. Fate Testarossa ve Arthra'nın mürettebatıyla video mesajlaşan Nanoha, onlarla tekrar yüz yüze konuşma fırsatını sabırsızlıkla bekler. Ancak bir gün odasında ders çalışırken, Raising Heart aniden Nanoha'ya seslenir ve yaklaşan bir saldırı hakkında onu uyarır! Saldırgan, kendini Belka Şövalyesi olarak adlandıran Vita adında genç bir kızdır. Gizemli bir kartuş sistemine sahip akıllı bir cihaz kullanarak Nanoha'yı hızla alt ederek gücünü kanıtlar. Neyse ki, tamamen ezilmeden önce Uzay-Zaman Yönetim Bürosu müdahale edebilir. Vita ve yoldaş şövalyeleri Shamal, Signum ve Zafila, Kayıp Logia'lardan biri olan Book of Darkness'ı tamamlamak için büyücülerden sihirli güç çalma görevindedir. Şövalyeler bu Book of Darkness'ın peşinde hangi şeytani amaçla koşuyorlar?