Önceki filmde ortaya çıkan Gigan orduları Dünya'ya tekrar saldırdı. Ayrıca, diğer Gigan'ları yöneten kırmızı renkli "Gigan Rex" adlı bir Gigan ortaya çıktı. Olağanüstü savaş yeteneğiyle övünen Gigan Rex'i Godzilla yenebilecek mi?