Özet

1973 yılında, altı yıl süren acımasız Ay Savaşı'nın ardından, BETA - uzay kökenli, insanlığın düşmanı olan varlıklar - olarak bilinen düşman uzaylı türü Dünya'yı istila ederek milyarlarca insanı öldürdü ve Avrasya'yı yerle bir etti. BETA geleneksel silahlarla yok edilebilse de, lazer sınıfları tüm uçak filolarını ortadan kaldırabiliyor, bu da insanlığın onlarla savaşmak için Taktik Yüzey Savaşçıları (TSF) adı verilen devasa savaş giysileri geliştirmesine neden oluyor. 1998'de BETA Japonya'ya ulaştığında, askeri okul öğrencisi ve TSF pilotu - ya da eishi - Yui Takamura, sınıf arkadaşlarıyla birlikte Kyoto'nun son savunma hattını savunmakla görevlendirilir. Sayısız insan hayatı ve Yui'nin arkadaşlarının fedakarlığı pahasına Japon İmparatorluk Ordusu istilacıları püskürtmeyi başarır ve arkasında yıkım bırakır. Ancak bu karşılaşma, Yui'yi bir daha böyle bir şeyin olmasına asla izin vermemeye kararlı hale getirir. Üç yıl sonra, şimdi teğmen olan Yui, Alaska merkezli bir Japon-Amerikan TSF geliştirme programı olan XFJ projesine katılır. İşbirliği yapmayan Japon-Amerikalı test pilotu Yuuya Bridges ve BETA'ya yenik düşmüş ülkelerden çeşitli eishilerden oluşan uluslararası bir ekipte Yui'nin görevi, yeni Japon TSF'si Shiranui'yi geliştirmeye yardım etmektir. Soğuk Savaş'tan miras kalan siyasi gerilimlerin ortasında, Muv-Luv Alternative: Total Eclipse, Yui'nin hassas görevini ve Yuuya'nın hala peşini bırakmayan geçmişin şeytanlarının üstesinden gelme yolculuğunu takip ediyor.