"Exodus Project" adlı uzun menzilli warp ile Worns, Ryer ve "Watchers Nest" mürettebatı Dünya'dan kaçmayı başarır. O sırada "Ghoul" ile son savaşta bulunan Misaki orada değildir ve gözlerinin önünde Dünya değişir ve bir zaman bariyeri ile çevrelenir. Ryer ve diğerleri bu uzay-zaman labirentinden kaçmanın bir yolunu ararlar, ancak Dünya çeşitli formlara bürünür. Farklı zaman eksenleri nedeniyle sa

"Exodus Project" adlı uzun menzilli warp ile Worns, Ryer ve "Watchers Nest" mürettebatı Dünya'dan kaçmayı başarır. O sırada "Ghoul" ile son savaşta bulunan Misaki orada değildir ve gözlerinin önünde Dünya değişir ve bir zaman bariyeri ile çevrelenir. Ryer ve diğerleri bu uzay-zaman labirentinden kaçmanın bir yolunu ararlar, ancak Dünya çeşitli formlara bürünür. Farklı zaman eksenleri nedeniyle sayısız "Şimdi" ortaya çıkar. Ayrıca, Exodus Project olayı yüzünden ortadan kaybolması gereken Misaki, buna rağmen hala oradadır. Ryer ve diğerlerinin karşısına Misaki'nin farklı formları çıkar. Eğitim okulundan Misaki, çocukluk günlerinden Misaki. Bunlar, Misaki'nin içindeki çatışmaların neden olduğu yansımalar mıdır? İkinci kez uyanır ve cevabı bulduğunda, tarihin artık tamamen farklı bir yöne gittiğini anlar. Misaki, Ryer ve diğerleri gerçek bir mutlu sona ulaşabilecekler mi?!