Göğün Ejderhaları ve Yerin Ejderhaları arasındaki savaşta, rüya gören Prenses Hinoto insanlığın sonunu öngörür. 15 yaşındaki merkezi bir varlık olan Kamui Shirou, gezegeni korumak için medeniyeti yok etmek üzere Yerin Ejderhaları ile ittifak kurmak ya da insanlığı kurtarmak için Göğün Ejderhaları ile ittifak kurmak arasında bir seçim yapacaktır. Annesinin son dileğini yerine getirmek için Kamui,

Göğün Ejderhaları ve Yerin Ejderhaları arasındaki savaşta, rüya gören Prenses Hinoto insanlığın sonunu öngörür. 15 yaşındaki merkezi bir varlık olan Kamui Shirou, gezegeni korumak için medeniyeti yok etmek üzere Yerin Ejderhaları ile ittifak kurmak ya da insanlığı kurtarmak için Göğün Ejderhaları ile ittifak kurmak arasında bir seçim yapacaktır. Annesinin son dileğini yerine getirmek için Kamui, altı yıllık kendi isteğiyle sürgünden sonra Tokyo'ya döner. Orada, çocukluk arkadaşları Fuuma ve Kotori'nin babası Kyougo Monou'nun koruduğu tapınaktan Kutsal Kılıç'ı çalmaya çalışır. Ancak Kamui'nin girişimi başarısız olduktan sonra, gizemli bir kişi kılıcı ele geçirmeyi başarır. Kamui'yi peygamberliğindeki adam olduğuna inanan Hinoto, onu kendi davalarına çekmek için Göğün Ejderhalarını onun peşine gönderir. Kamui ilk başta kaderini reddetse de, Yerin Ejderhalarının sevdiklerine yönelik amansız saldırıları, arkadaşlarının hayatlarının Dünya'nın kaderine mi baskın geleceğine karar vermesi ve nihayet bir taraf seçmesi için onu zorlar.