Shintarou Kisaragi—iki yıldır odasına kapanmış bir NEET—bir yıl önce kendisine anonim olarak gizemli bir e-posta gönderilmesiyle bilgisayar ekranında beliren Ene adında bir siber kızla tanışana dek hayatını normal bir şekilde yaşıyordu. Bir gün Ene, Shintaro'nun bilgisayarıyla uğraşırken, bu durum onu iki yıl sonra ilk defa dış dünyaya çıkmaya zorlar.