Özet

Inazuma Eleven Go: Chrono Stone, Kutsal Yol Futbol Turnuvası'ndan sonra geçmektedir. O anın kahramanı Tenma Matsukaze, çocuklara futbol öğretmek için Japonya'yı dolaşmıştır. Misyonunu tamamladıktan sonra Raimon Ortaokulu'na döner ancak şaşırtıcı bir şekilde burası artık hatırladığı Raimon Ortaokulu değildir. Futbol kulübü yok olmuştur ve Kutsal Yol Futbol Turnuvası'nın şampiyon takımının üyeleri turnuvaya katıldıklarına dair hiçbir şey hatırlamamaktadır. Ne Tenma'yı ne de sevdikleri futbol oyununu hatırlamıyorlar. Tenma bu gidişata şaşırıp kalmışken, Rota Ajanları'nın lideri ve Protocol Omega takımının kaptanı Alpha aniden karşısında belirir. Alpha, Raimon'daki futbol tutkusunu ve futbol kulübü üyelerinin futbolla ilgili anılarını silmekten kendisinin ve takımının sorumlu olduğunu ilan eder: ve Tenma'nın kendisi de sıradaki kişidir. Tam o sırada Fei Rune adında tuhaf bir çocuk onu kurtarmak için zamanında belirir. Fei kimdir ve Alpha neden futbolu temelli yok etmek istemektedir? Tenma, galip gelmek için elinden gelen her şeyi yapması gerektiğini bilmektedir. Bu, futbolun kaderini sonsuza dek mühürleyebilecek bir savaştır.