Japonya'yı fethetme arzusunda olan acımasız lord Daigo Kagemitsu, doğacak oğlunu 48 iblise kurban etmeyi teklif eder. İblisler kabul eder ve ertesi gün, çocuk kolu bacağı olmadan doğar ve nehre atılır. On beş yıl sonra, açlığa ve yoksul, savaşın yıprattığı bir köyün sokaklarındaki zalim samuraylara karşı inatçı bir genç olan Dororo hayatta kalma mücadelesi verir. Bir grup haydudu kızdırdıktan son

Japonya'yı fethetme arzusunda olan acımasız lord Daigo Kagemitsu, doğacak oğlunu 48 iblise kurban etmeyi teklif eder. İblisler kabul eder ve ertesi gün, çocuk kolu bacağı olmadan doğar ve nehre atılır. On beş yıl sonra, açlığa ve yoksul, savaşın yıprattığı bir köyün sokaklarındaki zalim samuraylara karşı inatçı bir genç olan Dororo hayatta kalma mücadelesi verir. Bir grup haydudu kızdırdıktan sonra Dororo saldırıya uğrar ancak yakında ruhları duyduğunu iddia eden gizemli bir adam araya girer. Beklendiği gibi, nehirden bir canavar çıkar ve adam protez kollarını çıkararak altlarında gizlenmiş bıçakları ortaya çıkarır ve canavarı öldürür. O gece, adam ormanda yürürken Dororo ona yaklaşır ve onunla birlikte gideceğini söyler. Bunun üzerine adam, Hyakkimaru, vücut parçalarının çoğunun iblisler tarafından çalındığını ve barışçıl bir hayat arzulasa da iblislerin amansız saldırılarından kaçamadığını açıklar. Bu hikayeye rağmen Dororo hala onunla gitmekte ısrar eder. Ve böylece Hyakkimaru, yeni yoldaşı ve Nota adında bir köpek yavrusuyla birlikte hem cehennemin hem de insanlığın vahşetiyle yüzleşerek Japonya'yı dolaşır.