Logan, bir yıl önce ortadan kaybolan kız arkadaşı Mariko Yashida'nın, Japon suç örgütü lideri ve AIM tedarikçisi olan babası Shingen tarafından Tokyo'ya götürüldüğünü öğrenir. Bunun üzerine, onu ne pahasına olursa olsun bulup geri getirmek için Japonya'ya gitmeye karar verir.