İnsan öncesi çağlardan çok daha önce, gelişmiş bir uzaylı türü Dünya'yı mesken tutmuştu. Sahip oldukları gücün farkında değildiler ve nihayetinde kendi sonlarını getirdiler. Ancak uzaylılar, gelecek uygarlıklara yok edilemez tabletler üzerinde bir uyarı bıraktılar: Kendi türlerinin yarattığı yıkıcı teknolojinin kalıntılarını yok etmek. Günümüzde, ARCAM Corporation ve onların paramiliter birimi Sp

İnsan öncesi çağlardan çok daha önce, gelişmiş bir uzaylı türü Dünya'yı mesken tutmuştu. Sahip oldukları gücün farkında değildiler ve nihayetinde kendi sonlarını getirdiler. Ancak uzaylılar, gelecek uygarlıklara yok edilemez tabletler üzerinde bir uyarı bıraktılar: Kendi türlerinin yarattığı yıkıcı teknolojinin kalıntılarını yok etmek. Günümüzde, ARCAM Corporation ve onların paramiliter birimi Spriggan'lar, emanetleri mühürlemeye ve haydutların güçlerini kötüye kullanmasını engellemeye çalışıyor. ARCAM'ın Ararat Dağları'nda efsanevi Nuh'un Gemisi olduğuna inanılan keşfinin ardından, Spriggan Yuu Ominae incelemek üzere gönderilir. Ancak site, Savunma Bakanlığı'nın radikal bir fraksiyonu olan ve Albay MacDougall tarafından yönetilen US Machine Corps tarafından basılır. Pentagon'un emirleri üzerine MacDougall, ARCAM'ın baş bilim insanını güvence altına almak ve eseri ele geçirmek istiyor. Diğer Spriggan Jean Jacquemondo ile ekip olan Yuu, çok geç olmadan Ark üzerine ilerlemelerini durdurmak için MacDougall ve Machine Corps'un seçkin askerlerini engellemek zorunda.