Saizou'nun, yani Kabamaru'nun korkunç derecede katı büyükbabası ve Iga ninjası hocasının (sensei) ölümünün ardından, yaşlı bir kadın olan Ran Ookubo, torununa bakmasını isteyen ondan bir mektup aldığını iddia eder. Bunun üzerine Kabamaru, yakisoba, ramen, çin böreği yemek ve kendine has tuhaflıkları olan sıradan bir okula gitmek için Leydi Ookubo ile birlikte büyük şehir Tokyo'ya kaçar.