Kei Narutani ve çocukluk arkadaşı Song Minghua, ülkelerini ve halklarını sebepsiz yere terörize eden gizemli bir örgüt olan Zai'den kaçan Çinli mültecilerdir. Neyse ki, Japonya'ya kaçışları sırasında tuhaf bir kırmızı uçak tarafından kurtarılırlar. Kei'nin bu uçağa olan merakı, onu kurtarıcısıyla tanışmasına yol açar: "Anima" olarak adlandırılan, "Daughter" adlı eşsiz bir uçak tipinin pilotu olan

Kei Narutani ve çocukluk arkadaşı Song Minghua, ülkelerini ve halklarını sebepsiz yere terörize eden gizemli bir örgüt olan Zai'den kaçan Çinli mültecilerdir. Neyse ki, Japonya'ya kaçışları sırasında tuhaf bir kırmızı uçak tarafından kurtarılırlar. Kei'nin bu uçağa olan merakı, onu kurtarıcısıyla tanışmasına yol açar: "Anima" olarak adlandırılan, "Daughter" adlı eşsiz bir uçak tipinin pilotu olan bir kız. Kızın adı Gripen, sevimli bir JAS-39F savaş uçağıdır. Kei, Gripen ile bir bağ kurar ve ardından Japonya Öz Savunma Kuvvetleri tarafından, Gripen'in uçuşla ilgili sorunlarının üstesinden gelmesine yardım etmek üzere işe alınır. Daha sonra tasasız bir F-15J-ANM olan Eagle ve gururlu bir RF-4EJ-ANM olan Phantom'un da katılmasıyla, manga silaha sarılır ve insanlığı korumaya kararlıdır. Beş birey, tehditkar uzaylı gücüne karşı son savunma hattını oluşturan, istilacı Zai'ye karşı savaşır.